天京内的队伍很多都是东王的嫡系，以东王至高无上的地位，怎么能说杀就杀？而且还是满门抄斩，大家纷纷要讨个说法。

韦昌辉这个时候有些紧张了，他害怕这些人要为杨秀清报仇，来找自己麻烦。

结果他让陈承瑢假借天王名义，对外宣传要惩罚韦昌辉和秦日纲，让东王的部下来看。六千多东王的嫡系队伍放下武器被骗到几间巨大的房子里，然后被锁在里面，并点燃了布置好的炸药。

可怜这些身经百战的老兄弟，没死在清军的刀下，却惨被自己人屠杀。炸药炸完后，北王的队伍又手持利刃进来，他们露一只胳膊在外，进来后见人就砍，把少部分没炸死的人都砍死了。

韦昌辉杀了这些人之后，还不放心，他又在城里展开新一轮大清洗。把那些被杀者的家眷也通通抓起来杀掉，无论是怀孕的妇女还是尚在吃奶的孩子，这场屠杀持续了近一个月，总共杀掉东党两万多人。

洪秀全几次下诏让他住手，不能再杀了，但韦昌辉已经杀红眼了，根本听不进劝告。

通过不断的杀戮，韦昌辉不在是那个唯唯诺诺的东王跟班，他露出了真实的面目。他想取代东王，让天国进入北王时代。

这个时候石达开把队伍留在安徽，只身到达了天京，他质问北王为什么要杀这么多人？

而韦昌辉却认为石达开心向杨秀清，是来讨伐自己的，没有答话但心里对石达开动了杀意。

当晚有人告密石达开北王要杀他，在心腹的帮助下，石达开沿着绳子爬下城墙，逃出天京城。

韦昌辉找不到石达开，他一面派秦日纲去追，一面包围了翼王府，将翼王府男女老少也全部杀害。

这个时候韦昌辉可以说是在天京人神共愤了，而他自己也感觉到了这一点，他没有停手，反而带兵去天王府，准备连天王也一起杀了，这样他就成了太平天国的一把手了。

洪秀全早就堤防他这一手，他一面牢牢防守天王府，一面昭告天京所有将士韦昌辉为北奸，人人得而诛之。